幕末时期，维新派在传奇的刽子手拔刀斋绯村剑心（凉风真世配音）引退后，选出同样具有高尚高贵剑术的志志雄真实（池田政典配音）继续着暗算任务。在维新即将获告捷利之际，为掩盖各种不成告人的奥秘，新当局密谋杀害志志雄。谁知全身遭到重度烧伤的志志雄却从地狱活转，怀着巨大的仇恨制定了“京都粉碎打算”，他的手下网罗了四乃森苍紫、濑田宗次郎、宇水、张等一多量高手。与此同时，剑心、京都御庭番众、斋藤、比谷清十郎纷纷步履起来，朝向京都进发。一场决定汗青命运的大战即将拉开序幕……本片按照和月伸宏的同名漫画改编“时间，我有很多的时间，无尽的时间一开始只有疯狂，然后是启示，然后又是疯狂，但或许这是好事，我看到了时间的生命，合法我见证着时间悲凉的那一面，我陷入了沉思，我有活过吗？我只是其他人故事中的物件吗？我就仅此而已？这点能改变吗？我有很是多的时间，却没有答案，没有意义的时间就像是监牢，我看到了永恒的思想，或是神的思想，但我只找到了沉寂”。